El estadounidense, de 28 años, se ha autoimpuesto una penalización en el segundo fairway al ver que la bola se movía, pero aun así ha salvado el par y ha firmado una tarjeta de 68 golpes, cuatro bajo par.
Ha terminado las 72 hoyos con un total de 19 bajo par (269 golpes), llevándose el premio mayor de 3,6 millones de dólares (2,6 millones de libras) en el Trump National Doral.
Young se ha convertido en apenas el tercer jugador que lidera de principio a fin en Doral, el primero desde Andy Bean en 1977.
"Cuando el campo de golf es complicado y las condiciones de juego son difíciles, eso suele ayudarme mentalmente", ha comentado Young.
"Esa es una parte fundamental para mantenerse concentrado aquí... por suerte he conseguido estar en el presente y pegar muchos buenos golpes."
Young, que cumplirá 29 años este jueves, conquistó su primer título del PGA en agosto pasado en Greensboro, ganó el Players Championship en marzo y el mes pasado compartió el tercer puesto en el Masters.
La diferencia de seis golpes con la que ha ganado iguala la mayor registrada en un torneo del PGA en Doral, algo que no ocurría desde que Hubert Green lo lograra en 1976.
"La confianza en uno mismo no deja de crecer", ha asegurado Young. "En los últimos cuatro o cinco años me he puesto en muchas buenas posiciones y últimamente he empezado a salir beneficiado, así que estoy ilusionado para las próximas semanas."
Ha caído más de una pulgada de lluvia durante la noche, lo que ha retrasado la ronda final de este evento de 20 millones de dólares tras ablandar el campo Blue Monster.
El presidente de Estados Unidos, Donald Trump, ha presenciado cómo Young embocaba su último putt desde un palco en el hoyo 18.
El número uno del mundo, Scottie Scheffler, ha hecho birdie en tres de los últimos cuatro hoyos para firmar 68 golpes y terminar segundo con 275, uno por delante de su compatriota Ben Griffin.
Para Scheffler ha sido el tercer subcampeonato consecutivo, tras acabar segundo en el Masters y en el Heritage el mes pasado. Desde 2014, ningún jugador había logrado tres segundos puestos seguidos en el PGA.
Este resultado llega en el último torneo de Scheffler antes de defender su título del PGA Championship dentro de dos semanas en Aronimink.
El australiano Adam Scott ha firmado una vuelta de 64 para compartir el cuarto puesto con 277 junto al austríaco Sepp Straka, que ha hecho 66, y el surcoreano Kim Si-woo, que ha cerrado con 70.
Lo ha gestionado muy bien
Tras autoimponerse la penalización en el segundo hoyo, Young ha dejado su golpe de aproximación a cuatro metros y ha embocado el putt clave para par, recuperando así el ritmo.
"Se te cae el alma cuando ves que la bola se mueve, pero se ha movido y eso forma parte del golf", ha explicado Young. "Nadie iba a sancionarme ahí salvo yo mismo.
"Ya me ha pasado unas cuatro veces en el PGA Tour, así que tengo que empezar a apoyar el palo un poco más suave, pero son cosas que pasan. ¿Cómo iba a mirar para otro lado y decir que no se movió, si rodó y avanzó un par de centímetros?
"Ha sido una pena, pero lo he gestionado bastante bien."
Después ha conseguido birdies con putts de algo menos de cuatro metros en el hoyo 3 y de algo más de cuatro metros en el 5.
En el par cinco del 8 ha alcanzado el green en dos golpes y ha embocado un putt de birdie de poco más de un metro, llegando al giro con siete de ventaja.
Luego ha hecho birdie en el par cinco del 12, entre bogeys en el 11 y el 13, y ha cerrado con un putt de birdie de casi cuatro metros en el par tres del 15. Además, ha alcanzado el green de salida en el par cuatro del 16 para dejarse un birdie dado.