Pepe fue declarado "indisponible", señaló el servicio médico de la FPF en un comunicado.
El capitán del Oporto sufre una lesión en la pierna derecha y ya fue baja con su equipo este fin de semana ante el Sporting Braga (0-0), en la 25ª jornada del campeonato.
Tras caer en cuartos del pasado Mundial ante Marruecos (1-0), Portugal inicia una nueva etapa con Roberto Martínez en el banquillo.
El técnico español incluyó en su primera lista a la leyenda de 38 años Cristiano Ronaldo, que ahora juega en el Al Nassr de Arabia Saudita.
Portugal juega ante Liechtenstein el 23 de marzo en Lisboa y se medirá a Luxemburgo como visitante tres días más tarde.