Williams, que sólo jugó dos torneos la temporada pasada, dijo en un acto en Dinamarca que no le habían informado de la wildcard antes de que el torneo la anunciara el miércoles y añadió que no podía competir debido a compromisos previos.
"El anuncio me pareció superdivertido porque, no sé, la gente parece estar contenta, así que pensé: 'Tal vez me deje llevar, no sé'", dijo Williams en el acto celebrado en la ciudad de Naestved.
"En realidad no voy a ir. Voy a estar en el extranjero".
El director del torneo, Tommy Haas, emitió más tarde un comunicado en el que confirmaba que Williams no jugaría en el evento del 2 al 16 de marzo en el sur de California.
"Nuestro equipo ha sido informado de que Venus no acepta el wildcard este año", rezaba. "Deseamos lo mejor a Venus y esperamos verla de vuelta en Indian Wells en el futuro".
Williams boicoteó el evento durante 15 años después de que los aficionados abuchearan e increparan a su hermana menor Serena durante su victoria en la final de 2001 sobre Kim Clijsters, aparentemente en respuesta a que Venus se retirara lesionada de su semifinal.
"Me encanta Indian Wells, me encantaría estar allí y si hubiera podido aceptarlo, habría dicho 'Sí', pero ya he adquirido compromisos", añadió Williams.